本總隊組織架構圖

本總隊置總隊長1人，副總隊長1人，主任秘書1人，幕僚單位設警務、後勤等2科，督察、保防、人事、會計等4室及勤務指揮中心，另為應業務需要，成立「秘書室」及「資訊室」等二個任務編組單位，勤務單位分設六個外勤隊（含十七個分隊、八十二個小隊、四一一處警勤室）。

註1：第一隊原派駐土地銀行，第二隊原派駐合作金庫（已民營化），於93年12月31日撤警。
註2：「秘書室」及「資訊室」為任務編組單位。